Struktur organisasi Program Studi Manajemen Pendidikan Islam (MPI) Fakultas Tarbiyah Universitas Islam Al-Aziziyah Indonesia disusun sebagai bentuk pembagian tugas, tanggung jawab, serta koordinasi dalam menjalankan tata kelola program studi secara efektif dan profesional. Struktur ini menunjukkan adanya hubungan kerja yang sistematis antara unsur pimpinan fakultas, pengelola program studi, tenaga kependidikan, dosen, hingga mahasiswa sebagai bagian utama dalam proses pendidikan.
Pada tingkat fakultas, kepemimpinan berada di bawah Dekan Fakultas Tarbiyah, yaitu Dr. Tgk. Muktar, M.Pd, yang bertanggung jawab dalam mengarahkan kebijakan akademik, administrasi, dan pengembangan kelembagaan fakultas. Dalam menjalankan tugasnya, Dekan dibantu oleh tiga unsur pimpinan, yaitu Wakil Dekan I yang membidangi akademik, Wakil Dekan II yang membidangi administrasi dan keuangan, serta Wakil Dekan III yang membidangi kemahasiswaan dan kerja sama. Posisi Wakil Dekan I dijabat oleh Tgk. Mursal, M.Ag, sedangkan Wakil Dekan II dijabat oleh Tgk. Syahrul Awali, M.Pd.
Dalam lingkup Program Studi Manajemen Pendidikan Islam, kepemimpinan program studi dipimpin oleh Ketua Prodi MPI, yaitu Tgk. Mursyidi, M.Pd. Ketua program studi memiliki peran penting dalam mengelola pelaksanaan tridharma perguruan tinggi, mulai dari penyusunan program akademik, pengembangan kurikulum, peningkatan mutu pembelajaran, hingga pengelolaan sumber daya manusia di lingkungan program studi. Dalam menjalankan tugas administrasi dan koordinasi akademik, Ketua Prodi dibantu oleh Sekretaris Prodi MPI, yaitu Tgk. Sara Yulis, M.Pd.
Selain itu, struktur organisasi juga dilengkapi dengan Kepala Laboratorium dan Ketua Unit UPM (Unit Penjaminan Mutu) Prodi MPI yang berfungsi mendukung peningkatan kualitas akademik dan mutu pendidikan. Kepala Laboratorium bertanggung jawab terhadap pengelolaan sarana praktik dan pengembangan keterampilan akademik mahasiswa, sedangkan Ketua Unit UPM berperan dalam melakukan monitoring, evaluasi, dan pengendalian mutu pendidikan di lingkungan program studi.
Untuk mendukung pelayanan administrasi dan pengelolaan informasi, Program Studi MPI memiliki Staf Umum dan Akademik serta Staf Data dan Informasi. Kedua bagian ini berfungsi membantu kelancaran administrasi akademik, pengarsipan data, pelayanan mahasiswa, serta pengelolaan informasi dan dokumentasi program studi. Keberadaan tenaga kependidikan tersebut menjadi bagian penting dalam mendukung efektivitas pelayanan akademik di lingkungan program studi.
Di bawah struktur pengelola program studi terdapat dosen sebagai pelaksana utama kegiatan pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat. Dosen memiliki tanggung jawab dalam melaksanakan proses pembelajaran, pembinaan akademik mahasiswa, serta pengembangan keilmuan di bidang Manajemen Pendidikan Islam. Selanjutnya, mahasiswa menjadi bagian akhir sekaligus fokus utama dalam struktur organisasi ini sebagai subjek pendidikan yang dibina untuk menjadi lulusan yang unggul, profesional, dan berakhlakul karimah.